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Text File  |  1996-03-09  |  2KB  |  33 lines
  1.        Document 0352
  2.  DOCN  M9650352
  3.  TI    Computer simulations to predict the availability of peptides with known
  4.        HLA class I motifs possibly generated by proteolysis of HIV-1 proteins
  5.        in infected cells.
  6.  DT    9605
  7.  AU    Becker Y; Department of Molecular Virology, Faculty of Medicine, Hebrew;
  8.        University of Jerusalem, Israel.
  9.  SO    Virus Genes. 1995;10(3):227-37. Unique Identifier : AIDSLINE
  10.        MED/96124518
  11.  AB    Cytotoxic T cells that recognize HIV-1 peptides generated from all viral
  12.        proteins were reported. To predict the cleavage pattern of HIV-1
  13.        proteins by cytoplasmic proteasomes into peptides with motifs fitting
  14.        known HLA class I molecules, the computer program Findpatterns was used.
  15.        In this paper the combined amino acids patterns for proteolytic
  16.        cleavages and the HLA class I haplotype-restricted peptides motifs are
  17.        studied. It was noted that peptides with motifs of HLA class I A2 and
  18.        A68 were abundant compared with HLA class 5B2, B8, B53, and B35.
  19.  DE    Amino Acid Sequence  Amino Acids/METABOLISM  Antigen Presentation
  20.        *Computer Simulation  Cysteine Proteinases/METABOLISM
  21.        Histocompatibility Antigens Class I/*IMMUNOLOGY  Human  HIV
  22.        Protease/METABOLISM  HIV-1/*IMMUNOLOGY  Molecular Sequence Data
  23.        Multienzyme Complexes/METABOLISM  Peptide
  24.        Fragments/IMMUNOLOGY/METABOLISM  Peptide Peptidohydrolases/METABOLISM
  25.        Software  Support, Non-U.S. Gov't  T-Lymphocytes, Cytotoxic/*IMMUNOLOGY
  26.        Viral Nonstructural Proteins/IMMUNOLOGY/METABOLISM  Viral
  27.        Proteins/*IMMUNOLOGY/METABOLISM  Viral Structural
  28.        Proteins/IMMUNOLOGY/METABOLISM  JOURNAL ARTICLE
  29.  
  30.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  31.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  32.  
  33.